H₂O
Água

H₂O

Óxido de hidrogênio.

Ciclo da Uréia (3D)

Ciclo do Ácido Cítrico (etapas 4.2.1.2 e 4.1.3.7)
3D (etapas 4.2.1.2 e 4.1.3.7)

Síntese e degradação de Corpos Cetônicos (3D)

Degradação de aspartato e asparagina (3D)

Degradação de isoleucina, leucina e triptofano (etapas 1.14.13.9; 1.5.1.-; 3.5.1.49; 3.7.1.3; 1.2.1.32; 4.2.1.17 na degradação de isoleucina; 4.2.1.17 na degradação de triptofano e 4.2.1.18)
3D (etapas 1.14.13.9; 1.5.1.-; 3.5.1.49; 3.7.1.3; 1.2.1.32; 4.2.1.17 na degradação de isoleucina; 4.2.1.17 na degradação de triptofano e 4.2.1.18)

Degradação de metionina, treonina, valina e isoleucina (etapas 4.2.1.17; 3.1.2.4; 4.4.1.1; 4.2.1.22 e 3.3.1.1)
3D (etapas 4.2.1.17; 3.1.2.4; 4.4.1.1; 4.2.1.22 e 3.3.1.1)

Degradação de fenilalanina, tirosina e leucina (etapas 3.7.1.2; 1.14.16.1 e 4.2.1.18)
3D (etapas 3.7.1.2; 1.14.16.1 e 4.2.1.18)

Degradação de prolina, histidina, arginina, glutamato e glutamina (etapas 1.4.1.2; 4.2.1.49; 3.5.3.1; um passo não catalisado; 3.5.2.7; 1.5.1.12 e 3.5.1.2)
3D (etapas 1.4.1.2; 4.2.1.49; 3.5.3.1; um passo não catalisado; 3.5.2.7; 1.5.1.12 e3.5.1.2)

Degradação de treonina, triptofano, glicina, alanina, cisteína e serina (etapas 1.14.13.9; 4.4.1.8; 2.1.2.1; 4.2.1.13; 3.7.1.3; 3.5.1.49; um passo não catalisado; e 1.13.11.20)
3D (etapas 1.14.13.9; 4.4.1.8; 2.1.2.1; 4.2.1.13; 3.7.1.3; 3.5.1.49; um passo não catalisado; e 1.13.11.20)

Degradação de triptofano e lisina (etapas 3.5.1.49; 1.14.13.9; 3.7.1.3; 1.5.1.9; 1.2.1.32; 1.5.1- e 4.2.1.17)
3D (etapas 3.5.1.49; 1.14.13.9; 3.7.1.3; 1.5.1.9; 1.2.1.32; 1.5.1- e 4.2.1.17)

Degradação de bases pirimídicas (etapas 3.1.3.5; 3.5.4.1; 3.5.2.2 e 3.5.1.6)
3D (etapas 3.1.3.5; 3.5.4.1; 3.5.2.2 e 3.5.1.6)

Degradação de bases púricas (etapas 3.5.4.6; 3.1.3.5; 3.5.4.4; 3.5.4.3 e 1.1.3.22)
3D (etapas 3.5.4.6; 3.1.3.5; 3.5.4.4; 3.5.4.3 e 1.1.3.22)

Excreção de ácido úrico (etapas 1.7.3.3; 3.5.2.5; 3.5.3.4 e 3.5.1.5)
3D (etapas 1.7.3.3; 3.5.2.5; 3.5.3.4 e 3.5.1.5)

Fermentação (etapas 1.2.2.2 e 1.2.1.3)
3D (etapas 1.2.2.2 e 1.2.1.3)

Neoglicogênese (etapas 4.2.1.11; 3.1.3.11 e 3.1.3.9)
3D (etapas 4.2.1.11; 3.1.3.11 e 3.1.3.9)

Degradação de lipídios (3D)

Síntese de alanina, valina, isoleucina e leucina (3D)

Síntese de aspartato, metionina, lisina e treonina (etapas 4.2.3.1; 4.4.1.8; 4.2.1.52; e 3.5.1.18)
3D (etapas 4.2.3.1; 4.4.1.8; 4.2.1.52; e 3.5.1.18)

Síntese de glutamina, arginina, glutamato e prolina (etapas 3.5.1.16 e 1.4.1.2)
3D (etapas 3.5.1.16 e 1.4.1.2)

Síntese de glicina, serina e cisteína (etapas 3.1.3.3; 2.1.2.1; 4.2.1.22 e 4.4.1.1)
3D (etapas 3.1.3.3; 2.1.2.1; 4.2.1.22 e 4.4.1.1)

Síntese de histidina (etapas 3.6.1.31; 3.5.4.19; 4.2.1.19; 3.1.3.15)
3D (etapas 3.6.1.31; 3.5.4.19; 4.2.1.19; 3.1.3.15)

Síntese de fenilalanina e tirosina (3D)

Síntese de triptofano (etapas 4.1.1.48 e 4.2.1.20)
3D (etapas 4.1.1.48 e 4.2.1.20)

Síntese de ácidos graxos (3D)

Síntese de colesterol (etapas 4.1.3.5; 1.14.99.7 e uma não catalisada)
3D (etapas 4.1.3.5; 1.14.99.7 e uma não catalisada)

Síntese de desoxiribonucleotídeos (3D)

Síntese de fosfolipídios (3D)

Síntese de ribonucleotídeos de bases pirimídicas (3D)

Síntese de ribonucleotídeos de bases púricas (etapas 2.1.2.2; 2.4.2.12; 6.3.5.3; 3.5.4.10 e 1.1.1.205)
3D (etapas 2.1.2.2; 2.4.2.12; 6.3.5.3; 3.5.4.10 e 1.1.1.205)

Via das pentoses (3D)

Fotossíntese (Kyoto University)
Fixação de carbono (Kyoto University)
Metabolismo de riboflavina (Kyoto University)