O ciclo como um todo é regulado por: disponibilidade de substrato, inibição por acúmulo de produto, e inibição alostérica das "primeiras" enzimas da via pelos "últimos" intermediários.

Em condições normais a velocidade da glicólise e do Ciclo do Ácido Cítrico estão integradas de forma que a quantidade de glicose  metabolizada a piruvato é apenas a necessária para suprir o Ciclo.