A regulação hormonal é realizada através da fosforilação da  enzima, ou seja por ligação covalente e portanto mais lenta. A adrenalina, através do AMPcíclico ativa a fosforilase quinase por fosforilação. Esta por sua vez faz o mesmo com a fosforilase a do glicogênio. A adernalina está associada a momentos em que é necessária um grande carga energética, sendo importante  amobilização das reservas de glicogênio do músculo.

Há um segundo tipo desta enzima, a fosforilase b, que é regulada alostericamente (e portanto mais rapidamente). Os moduladores neste caso são o ATP (em altas concentrações no repouso, inibindo a atividade da enzima), e o AMP (de efeito contrário, estando em maiores concentrações durante o gasto de ATP).