O RNA, ao contrário do DNA, possui fita simples de nucleotídeos unidas por ligações fosfodiésteres, sendo menos estável que a molécula de DNA. Dessa forma, as estruturas tridimensionais assumidas pelos vários tipos de RNA (ribossômico, mensageiros, transportadores) tornam-se mais complexas. O empilhamento de bases, então, também assume papel crucial na estabilização deste ácido nucléico.

Fragmentos de RNA podem parear-se com outras regiões da mesma molécula, assumindo uma forma de dupla hélice A, são as chamadas alças em grampo, presentes especialmente em RNA transportador, e que também contribuem na estrutura tridimensional na molécula.

O RNA possui vários tipos tais como RNA’s ribossômicos, mensageiros, transportadores, cuja função principal é transcrever e traduzir a informação contida no DNA, especialmente na formação de proteínas.