São enzimas que methylam especificamente carbonos C-5 das cytosines no DNA. Estas enzimas são encontradas em algumas proteínas,como componentes por exemplo do sistema de restrição-modificação tipo II em procariontes e alguns bacteriófagos.

Estas enzimas comungam um número de pequenas regiões conservadas. Duas servem de assinatura para reconhecimento. A primeira, centrada em um conservado dipeptídeo proline-cysteine, na qual a cysteine está envolvida nomecanismo catalítico, aparentemente formando um intermediário covalente com o carbono 6. A segunda região está localizada na extremidade C-terminal em enzimas tipo II.
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